• Добавить в закладки
  • Facebook
  • Twitter
  • Telegram
  • VK
  • Печать
  • Email
  • Скопировать ссылку
22.04.2022, 09:00
Татьяна Федина
1 975

Эволюция «омикрона»: от мышки к кошке, от кошки к мышке, от мышки к человеку

❋ 4.3

Ученые исследовали субварианты «омикрона» BA.1 и BA.2, проверили их способность к связыванию с мембранным белком ACE2 человека, мыши и кошки. В итоге они пришли к выводу, что мышь была главным хозяином для эволюции «омикрона», который прошел через кошку, вернулся к мыши и потом уже перешел к человеку.

© Pixabay / Автор: Pinaria Caprarius

Всемирная организация здравоохранения 22 марта объявила, что субвариант BA.2 омикрон-штамма стал доминирующей формой SARS-CoV-2 — вируса, вызывающего Covid-19, — во всем мире. BA.2 имеет много генетических сходств со своим близким родственником BA.1, что привело к глобальному всплеску заболеваемости в последние месяцы.

Но BA.2 на 30-50 процентов заразнее BA.1. Он быстро распространился по миру и стал доминирующим вариантом из-за более высокой инфекционности.

Белок-«шип» — это S-белок, из которого состоит оболочка коронавируса и которой он цепляется к человеческим клеткам. Китайские исследователи биохимически проанализировали сродство связывания белка-«шипа» BA.2 с человеческим ферментом ACE2: их работа показала примерно в два раза более высокое сродство, чем у BA.1, и в 11 раз выше, чем у штамма WТ (дикий тип).

Взаимодействие белка-«шипа» с ACE2 — первый этап связывания вируса с рецептором хозяина, что критически важно для проникновения патогена и последующих инфекций. Таким образом, более высокая связывающая способность белка-«шипа» BA.2, вероятно, обуславливает его особую трансмиссивность.

Кроме того, результаты исследования помогли выявить возможного исходного хозяина для BA.1 и BA.2. Как сообщалось, «омикрон» эволюционировал независимо от всех других штаммов коронавируса и его происхождение остается загадкой. Расследование происхождения BA.1 и BA.2 имеет решающее значение для эффективного контроля и профилактики Covid-19 в человеческой популяции.

Анализ профиля мутаций предполагает, что варианты «омикрона», возможно, возникли в результате эволюции через мышь в качестве хозяина. В новом исследовании биохимические данные подтвердили, что белки-«шипы» BA.1 и BA.2 способны с высокой аффинностью связываться с ACE2 мыши и кошки. В то же время шипиковый белок штамма WT хорошо связывается с ACE2 кошки, но не связывается с ACE2 мыши. Это указывает на высокую восприимчивость мыши и кошки к BA.1 и BA.2.

«Мы определили структуры «шипов» как из BA.1, так и из BA.2 в комплексе с мышиным белком ACE2 и выявили три остаточные мутации, которые необходимы для связывания с белком ACE2 мыши, что указывает на их важность при инфекциях. Удивительно, но две из трех необходимых мутаций были обнаружены в адаптированных к мыши SARS-CoV-2 и с тех пор не были выявлены ни в каких вариантах SARS-CoV-2 от других животных», — рассказал один из авторов исследования.

Основываясь на данных своей работы в сочетании с предыдущими, ученые предположили, что мышь — вероятно, ключевое животное-хозяин для эволюции вариантов «омикрона».

«Взятые вместе, наши данные раскрывают структурное и биохимическое понимание повышенной трансмиссивности и связывание антителами BA.2, а также возможный эволюционный путь для вариантов «омикрона». По нашим данным, они перешли от человека к кошке, затем — к мыши, а потом обратно к человеку. Хотя такой путь эволюции весьма умозрительный, способность вариантов «омикрона» заражать мышей и распространяться среди них и, возможно, среди других животных может иметь важные последствия для разработки стратегий контроля в борьбе с коронавирусной инфекцией», — подытожили авторы исследования.

Штамм «омикрон» оказался настолько отличающимся от более ранних, что и вакцины, и иммунитет переболевших эффективны против него ограниченно. Если подобный путь мутаций — через живущих рядом с человеком животных — повторится, нас может ждать еще один штамм, умеющий обходить прошлые варианты антикоронавирусного иммунитета.

Нашли опечатку? Выделите фрагмент и нажмите Ctrl + Enter.
Подписывайтесь на нас в Telegram, Яндекс.Новостях и VK
Предстоящие мероприятия
12 июля, 22:10
Редакция Naked Science

Лето 2025 обещает насыщенную линейку научно-фантастических сериалов на ведущих стриминговых платформах. От адаптаций культовых романов до масштабных космических одиссей — мы отобрали проекты, на которые стоит обратить внимание.

11 июля, 10:36
Александр Березин

Трижды негативный рак молочной железы отличается от других тем, что исключительно тяжело лечится, прогноз для пациента с ним хуже обычного. Особенно это верно, если его в норме медленно распространяющиеся колонии вдруг начинают быструю экспансию. Исследовательской группе удалось показать, что влияет на этот процесс.

10 июля, 10:46
Игорь Байдов

В последние годы исследователи добились прогресса в изучении древней ДНК, что позволило получить достаточно полное представление об организмах, живших в далеком прошлом. Но у ДНК есть одна проблема: она редко сохраняется в образцах более двух миллионов лет. В таком случае в качестве источника генетической информации ученые используют древние белки. Авторы новой работы заявили, что им удалось извлечь белки из зубной эмали возрастом 18 миллионов лет. Это рекорд, который почти в пять раз превышает предыдущее достижение.

8 июля, 16:07
Денис Яковлев

Некоторые виды рака все чаще «молодеют», особенно в странах с высоким уровнем дохода. За последние 10 лет только в США число новых случаев рака желудочно-кишечного тракта у пациентов до 50 лет выросло на 14,8 процента. Увеличивается частота колоректального рака, рака поджелудочной железы, пищевода и желудка, аппендикса, желчных путей. Американские онкологи назвали основные факторы риска для этих видов рака.

8 июля, 11:31
Редакция Naked Science

Белорусский бренд Hvilina представил коллекцию наручных часов Universum Cosmographia с трёхмерным планетарием и GMT-диском в виде стилизованной звёздной карты IX века. Вдохновением стали старинные астрономические атласы и изобретательность человека в поисках истины. 3D-модель Солнечной системы, декор механизма в планетарном стиле и отсылки к средневековым источникам раскрывают переход от представлений древних астрономов и философов к современным достижениям науки и космонавтики. Новинка создана при участии почётного профессора Университета Сорбонны.

8 июля, 11:16
РНФ

Ученые предложили математический инструмент, позволяющий точно рассчитать условия стабильной работы систем фазовой автоподстройки частоты, используемых в устройствах связи и навигации. Такие системы синхронизируют параметры собственных сигналов устройства, например телефона, с поступающими на него сигналами, например, от Wi-Fi-роутера. Предложенный метод расчетов позволяет избежать неточностей, которые допускали ранее используемые подходы, и предлагает инженерам простые формулы, удобные для применения в реальных проектах. Это позволит предотвратить ошибки в работе приборов спутниковой навигации и беспроводной связи.

17 июня, 16:49
Адель Романова

Радиотелескопы уловили очень короткий сигнал, и по его характеристикам стало ясно, что он не может быть естественного происхождения. Астрономы пришли к выводу, что источник находился в околоземном пространстве — там, где уже более полувека летает «мертвый» аппарат NASA.

25 июня, 15:19
ФизТех

Группа российских ученых из Института прикладной математики имени М. В. Келдыша РАН и МФТИ провела детальное численное исследование источников шума, генерируемых крылом прототипа сверхзвукового бизнес-джета в режиме посадки. Эта работа, сочетающая передовые методы вычислительной гидродинамики и аэроакустики, впервые позволила с высокой точностью локализовать и охарактеризовать основные зоны шумообразования вблизи полноразмерной геометрии крыла модели прототипа сверхзвукового пассажирского самолета в посадочной конфигурации.

2 июля, 11:17
Юлия Тарасова

Результаты эксперимента в США в будущем могут позволить добиться разрешения на использование отработанной конопли в качестве кормовой добавки в животноводстве.

[miniorange_social_login]

Комментарии

Написать комментарий
Подтвердить?
Подтвердить?
Причина отклонения
Подтвердить?
Не получилось опубликовать!

Вы попытались написать запрещенную фразу или вас забанили за частые нарушения.

Понятно
Жалоба отправлена

Мы обязательно проверим комментарий и
при необходимости примем меры.

Спасибо
Аккаунт заблокирован!

Из-за нарушений правил сайта на ваш аккаунт были наложены ограничения. Если это ошибка, напишите нам.

Понятно
Что-то пошло не так!

Наши фильтры обнаружили в ваших действиях признаки накрутки. Отдохните немного и вернитесь к нам позже.

Понятно
Лучшие материалы
Закрыть
Войти
Регистрируясь, вы соглашаетесь с правилами использования сайта и даете согласие на обработку персональных данных.
Ваша заявка получена

Мы скоро изучим заявку и свяжемся с Вами по указанной почте в случае положительного исхода. Спасибо за интерес к проекту.

Понятно