• Добавить в закладки
  • Facebook
  • Twitter
  • Telegram
  • VK
  • Печать
  • Email
  • Скопировать ссылку
2 апреля, 07:42
ФизТех
443

Ученые предложили новый протокол для изучения постковидного рака

❋ 4.4

Вирус ковида имеет долгосрочные последствия для организма человека, и уже установлено его отрицательное влияние на ход распространенных болезней, в том числе онкологических заболеваний. Эти негативные изменения требует от здравоохранения новых решений не только в лечении, но и сборе материалов. Новый подход сбора данных, разработанный учеными МФТИ, заложит основу для столь необходимых исследований рака в постковидное время и позволит разработать эффективную индивидуальную терапию.

Ученые предложили новый протокол для изучения постковидного рака – иллюстрация к материалу на Naked Science
Ученые МФТИ предложили расширить протокол сбора биоматериалов для учета последствий ковида в онкологии / © US Navy Mass Communication Specialist 2nd Class Sara Eshleman, ru.wikipedia.org

Результат опубликован в журнале HEAD & NECK. К декабрю 2023 года COVID-19 привел к 6,9 миллионам смертей из 772 миллионов случаев. К сожалению, переболевшие пациенты часто сталкиваются с разнообразными последствиями, включая постковидный синдром, который влияет на 40 % инфицированных, изменяя молекулярные характеристики организма. Поскольку рак является одним из наиболее распространенных заболеваний во всем мире, ожидается, что значительная часть населения будет страдать как от последствий COVID-19, так и от рака. Нарушенное микроокружение опухоли является одним из ключевых факторов, влияющих на патогенез — механизм возникновения и развития рака у пациентов с ковидом в анамнезе.

Таким образом, существует несколько критических изменений, связанных с COVID-19, внутри клетки-хозяина и в микроокружении ткани, включая внеклеточный матрикс — основа соединительной ткани, обеспечивающая механическую поддержку клеток и транспорт химических веществ. Они являются многообещающими мишенями для терапии. Например, одним из наиболее заметных долгосрочных последствий COVID-19 является фиброз легких — известный фактор риска рака легких. Молекулярные и механические изменения внеклеточного матрикса вследствие фиброза легких хорошо изучены. Упрощенно: он становится более жестким, что, в свою очередь, может влиять на поведение раковых клеток в таком микроокружении.

Более того, ожидается, что под действием COVID-19 модифицируется не только микроокружение, но и другие органы, что способствует онкогенезу и метастазированию. Так, субъединица спайка S1 SARS-CoV-2 индуцирует активацию клеток микроглии головного мозга — тканевых макрофагов центральной нервной системы, клеток врожденного иммунитета головного мозга, участвующих в развитии первичной опухоли, включая глиому. Подобные клетки составляют примерно 30 % ее массы.

Концепция двунаправленной связи между COVID-19 и раком предполагает, что рак изменяет восприимчивость человека к ковиду и наоборот. Молекулярные и механические изменения тканей и органов, вызванные вирусом, могут вызывать долговременные изменения в предраковом и злокачественном микроокружении тканей, тем самым влияя на реакцию раковых клеток на терапию.

Таким образом, изучение влияния вируса на развитие онкологии — своевременная и важная задача, которую можно решить с помощью исследований материалов пациентов современных биобанков, которые уже играют важную роль в развитии многих отраслей биотехнологии и биомедицины. Традиционно в биобанках преимущественно собирали ДНК, кровь, замороженные опухолевые ткани, а также фиксированные в формалине парафинизированные образцы. Но последние достижения в области «омических» исследований (транскриптомика, геномика, протеомика), разработка систем 3D-культуры тканей и интеграция передовых биоинформационных инструментов произвели революцию в биобанкинге.

Биобанки нового типа — уже не просто хранилища. Расширение перечня собранных материалов позволит проводить проверки действия лекарственных препаратов, откроют новые возможности для изучения предраковых ниш, редких форм рака, а также прогнозировать развитие резистентных к лечению популяций раковых клеток и клеточной трансформации. В совокупности это открывает дополнительные пути для разработки персонализированных стратегий лечения.

«С начала пандемии внимание медицинского сообщества было приковано к последствиям, которые вызывает вирус. В первую очередь они были связаны с системой микроциркуляции и иммунной системой. Затем появились публикации, которые стали подтверждать ухудшение прогнозов у пациентов с разными видами рака, или определенные последствия, которые продвигали пациентов в сторону онкологии.

Для учета всех этих последствий нам необходимо уже сейчас расширить стандартные протоколы сохранения биоматериалов. Это позволит предоставить полноценную информацию развивающимся модельным тест системам, в том числе инвитро, которые по разным компонентам — внеклеточному матриксу, составу внеклеточных везикул, по микрорнк — помогут проследить состояние здоровья человека», — отметила Евгения Шабалина, научный сотрудник лаборатории структурно-функциональных исследований инновационных противоопухолевых средств МФТИ.

Для достижения этих целей ученые предлагают следующую стратегию сбора биологических образцов:

Стадия А (смотрите рисунок) — получение биоптата опухолевой и нормальной ткани человека. Она включает: А1 — секционирование свежей ткани на 4 части: А2 — биобанкирование живых клеток, А3 — генетические исследования, А4 — получение внеклеточного матрикса, А5 — гистологическая фиксация.

Ученые предложили новый протокол для изучения постковидного рака – иллюстрация к материалу на Naked Science
Сбор биообразцов человека для скрининга и биобанкинга / © Пресс-служба МФТИ

Стадия В — помещение образцов крови в центрифугу. Она включает: В1 — выделение лейкоцитарной массы, В2 — сыворотки, В3 — лейкоцитарная масса исследуется с помощью проточной цитометрии — В4 и подвергается замораживанию в биобанке — В5.

Стадия С — собираются образцы микробиоты с использованием свабов и замораживаются в биобанке.

«Эта схема наглядно показывает, что одной из самых важных задач биобанков является сохранение живых клеток. Мы должны сохранять клетки крови, ткани, генетические материалы, матриксы. Это все разные протоколы. Те же замороженные живые опухолевые клетки позволяют нам в лабораторных условиях проверять их реакцию на различные препараты на этапе проведения биопсии. Сейчас это мало распространенная практика, поскольку требует более усложненного ведения биообразцов, расширенной базы данных и так далее, и так далее.

Мы, напротив, считаем, что эти исследования очень важны и позволяют нам проследить историю развитию болезни, понять, откуда пришли первые признаки, что первое сломалось, какие регуляторные механизмы были задействованы. Более полные протоколы сохранения биоматериала позволяют нам воспроизвести эту картину и провести дополнительные эксперименты, поскольку мы имеем живой биоматериал», — заключила Евгения Шабалина.

В работе была собрана коллекция биоматериалов пациентов с онкологическими заболеваниями, как перенесших COVID-19, так и нет, и разработан протокол сбора биологических образцов для валидации in vitro тест-системы персонализированного прогноза эффективности противоопухолевой терапии.

Исследование показало, что для продуктивного анализа множества факторов, приводящих к ухудшению сценария развития болезни, необходимо уделять особое внимание методам сбора и долгосрочного хранения образцов. Такой подход позволяет максимально раскрывать потенциал биобанков в контексте онкологических исследований.

Нашли опечатку? Выделите фрагмент и нажмите Ctrl + Enter.
Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет), известен также как Физтех — ведущий российский вуз по подготовке специалистов в области теоретической, экспериментальной и прикладной физики, математики, информатики, химии, биологии и смежных дисциплин. Расположен в городе Долгопрудном Московской области, отдельные корпуса и факультеты находятся в Жуковском и в Москве.
Подписывайтесь на нас в Telegram, Яндекс.Новостях и VK
16 августа, 19:09
Адель Романова

Астрономы подсчитали, что с поверхности летящего по Солнечной системе межзвездного объекта 3I/ATLAS каждую секунду испаряется около 40 килограммов водяного льда. Такую сильную кометную активность он проявил, будучи в три с половиной раза дальше Земли от Солнца. По мнению ученых, это довольно необычно.

16 августа, 11:58
Александр Березин

Новый подход к быстрому поиску жизни может однозначно обнаруживать ее всего одним инструментом. Он уже есть на борту обоих действующих американских марсоходов. Правда, NASA может не захотеть воспользоваться этой возможностью.

17 августа, 11:56
Любовь С.

Чтобы понять, как именно мозг объединяет разные сенсорные сигналы, ученые проверили реакцию добровольцев на простые визуальные и слуховые стимулы, отслеживая изменения в движении точек на экране и в звуковых сигналах с помощью ЭЭГ. Результаты показали, что за обработку информации ответственны разные процессы, которые «сходятся» в едином механизме в решающий момент.

16 августа, 19:09
Адель Романова

Астрономы подсчитали, что с поверхности летящего по Солнечной системе межзвездного объекта 3I/ATLAS каждую секунду испаряется около 40 килограммов водяного льда. Такую сильную кометную активность он проявил, будучи в три с половиной раза дальше Земли от Солнца. По мнению ученых, это довольно необычно.

16 августа, 11:58
Александр Березин

Новый подход к быстрому поиску жизни может однозначно обнаруживать ее всего одним инструментом. Он уже есть на борту обоих действующих американских марсоходов. Правда, NASA может не захотеть воспользоваться этой возможностью.

14 августа, 08:50
Юлия Трепалина

Ученые знают о возможности реверсии, или изменения, одного пола на другой у рыб, земноводных и рептилий. Но задокументированных случаев подобного у диких птиц и млекопитающих мало. Исследователи недавно обнаружили, что в Австралии смена пола у пернатых может быть не таким редким явлением.

25 июля, 07:47
Адель Романова

Прибывшая из межзвездного пространства предполагаемая комета 3I/ATLAS движется по траектории, максимально удобной для гравитационных маневров управляемого корабля, при этом возможность ее отслеживания с Земли практически минимальна. По мнению некоторых ученых, такое «поведение» объекта наводит на определенные мысли.

6 августа, 20:59
Татьяна Пичугина

Примерно 12 800 лет назад в Северном полушарии началось резкое изменение климата, которое сопровождалось вымиранием мегафауны и угасанием культуры Кловис. Такое могло произойти, например, из-за прорыва пресных вод в Атлантику или мощного вулканического извержения. Несколько лет назад ученые обнаружили места на суше с повышенным содержанием элементов платиновой группы, прослоями угля, микрочастицами расплава. По их мнению, это может быть признаком пребывания Земли в потоке обломков кометы или астероида. В новой работе впервые представлены доказательства кометного события в позднем дриасе из морских осадочных толщ.

22 июля, 14:44
ФизТех

Команда исследователей из Сколтеха, МФТИ, Института искусственного интеллекта AIRI и других научных центров разработала метод, позволяющий не просто отличать тексты, написанные человеком, от сгенерированных нейросетью, но и понимать, по каким именно признакам классификатор принимает решение о том, является ли текст генерацией или нет.  Анализируя внутренние состояния глубоких слоев языковой модели, ученые смогли выделить и интерпретировать численные признаки, отвечающие за стилистику, сложность и «степень уверенности» текста.

[miniorange_social_login]

Комментарии

Написать комментарий
Подтвердить?
Подтвердить?
Причина отклонения
Подтвердить?
Не получилось опубликовать!

Вы попытались написать запрещенную фразу или вас забанили за частые нарушения.

Понятно
Жалоба отправлена

Мы обязательно проверим комментарий и
при необходимости примем меры.

Спасибо
Аккаунт заблокирован!

Из-за нарушений правил сайта на ваш аккаунт были наложены ограничения. Если это ошибка, напишите нам.

Понятно
Что-то пошло не так!

Наши фильтры обнаружили в ваших действиях признаки накрутки. Отдохните немного и вернитесь к нам позже.

Понятно
Лучшие материалы
Закрыть
Войти
Регистрируясь, вы соглашаетесь с правилами использования сайта и даете согласие на обработку персональных данных.
Ваша заявка получена

Мы скоро изучим заявку и свяжемся с Вами по указанной почте в случае положительного исхода. Спасибо за интерес к проекту.

Понятно