14.01.2017, 07:15
Редакция Naked Science
618

Ученые полностью расшифровали геном арабики

Американские ученые полностью секвенировали последовательности ДНК и РНК кофе аравийского (Coffea arabica). Об этом пишет EurekAlert!.

8076838189_2e7620c711_k
©Wikipedia / Автор: Дмитрий Жуков

Кофе аравийский, или арабика, представляет собой наиболее распространенный вид кофейного дерева: свыше 70 процентов мирового производства одноименного напитка приходится на него. Несмотря на это, до сих пор полный геном арабики оставался неясным. В 2014 году исследователи расшифровали геном другого вида — кофе конгозелского (Coffea canephora), менее дорогого и генетически сложного.

 

Чтобы восполнить пробел, ученые из Калифорнийского университета в Дейвисе и других вузов собрали образцы 23 деревьев арабики сорта «гейша» на разных стадиях цветения и секвенировали последовательности ДНК и РНК 22 из них. Результаты показали, что C. arabica является гибридом C. canephora и родственного ему кофе евгениевидного (Coffea eugenioides) и имеет четыре набора хромосом.

 

Геном «гейши» включает в себя 1,19 миллиарда пар нуклеотидных оснований, что примерно соответствует одной трети человеческого генома, и 70 830 генов. По мнению участников работы, расшифровка поможет прояснить ароматические и иные свойства растения, а также повысить его устойчивость к экологическому стрессу. Сейчас плантации арабики находятся под влиянием изменений климата.

Информация о геноме арабики размещена в базе Phytozome. Подробности исследования будут представлены на 25-й Конференции по вопросам генома животных и растений в Сан-Диего 15 января.

 

Видеосюжет об исследовании. / © University of California, Davis

Нашли опечатку? Выделите фрагмент и нажмите Ctrl (Cmd) + Enter.
Подписывайтесь на нас в Telegram, Яндекс.Новостях и VK
Предстоящие мероприятия
14 сентября, 07:49
Марк Чернов

Британские физики впервые визуализировали процесс, при котором две отрицательно заряженные молекулы ДНК сближаются и пристыковываются друг к другу точно в местах с одинаковым генетическим кодом вопреки ожидаемому отталкиванию. Прямое наблюдение этого механизма подтвердило 20-летнюю гипотезу и раскрыло фундаментальные процессы восстановления генома, деления клеток и развития онкологических заболеваний.

14 сентября, 11:27
Марк Чернов

Японские ученые выяснили, что даже короткий вдох аромата свежесваренного кофе способен быстро улучшить эмоциональное состояние и уменьшить уровень стресса. У молодых участников эксперимента всего за пять минут вдыхания кофейного аромата снизились показатели тревожности, усталости и подавленности. При этом частота сердечных сокращений практически не изменилась.

14 сентября, 10:27
Игорь Байдов

Падение астероида примерно 66 миллионов лет назад запустило цепь событий, которые привели к вымиранию нептичьих динозавров. Однако некоторые группы пресмыкающихся пережили эту катастрофу и начали быстро восстанавливаться. Всего через несколько сотен тысяч лет после случившегося в реках Северной Америки уже охотился двухметровый хищник с необычными зубами, способными дробить твердую пищу. Его остатки помогли ученым понять, как аллигаторы развивались практически сразу после вымирания.

9 сентября, 22:44
Александр Березин

Нейросеть OpenAI добилась серьезного прорыва в математике, решив одну из семи «задач тысячелетия». Получат ли США, чьи нейросети опираются на гораздо более мощное «железо», чем у Китая, монополию на конвейер научных открытий? Даст ли это возможности сравнимые с их атомной монополией 80 лет назад?

8 сентября, 15:58
Елизавета З.

В конце августа 2026 года американские военные впервые применили высокоэнергетическую лазерную систему. С тех пор активность дронов у мексиканской границы снизилась примерно на 75%.

11 сентября, 10:25
Александр Березин

Современная космология до недавнего времени опиралась на так называемый космологический принцип, по которому у Вселенной нет какого-то выделенного направления. И наблюдатель в любой ее точке должен видеть однородную в этом смысле картину. Астроном из Северокавказской астрофизической обсерватории показал, что это не так даже для очень древней Вселенной.

9 сентября, 22:44
Александр Березин

Нейросеть OpenAI добилась серьезного прорыва в математике, решив одну из семи «задач тысячелетия». Получат ли США, чьи нейросети опираются на гораздо более мощное «железо», чем у Китая, монополию на конвейер научных открытий? Даст ли это возможности сравнимые с их атомной монополией 80 лет назад?

28 августа, 15:43
Татьяна Зайцева

Сопротивление жителей Европы самой идее употребления насекомых в пищу может иметь эволюционные корни, уходящие вглубь тысячелетий, пришли к выводу авторы нового исследования. Оказалось, предки современных европейцев ели насекомых лишь эпизодически. Кроме того, из-за генетических мутаций они плохо переваривали их экзоскелеты.

19 августа, 18:31
Александр Березин

После сокращения длины очередей и роста доступности бензина в первую неделю августа ситуация снова ухудшилась. Если с 20 июня по начало августа кризис носил в основном психологический характер, то сейчас ситуация принципиально иная: августовские атаки на НПЗ показали, что меры по усилению их противовоздушной обороны не были достаточно полными. Значит, прогноз автора Naked Science от 19 июля о том, что острая фаза кризиса закончится до конца лета, был частично неверным.

[miniorange_social_login]

Комментарии

Написать комментарий