• Добавить в закладки
  • Facebook
  • Twitter
  • Telegram
  • VK
  • Печать
  • Email
  • Скопировать ссылку
11.07.2023, 13:06
ФизТех
1,8 тыс

Установлен механизм транспорта протонов внутрь клетки

❋ 4.6

Биофизики МФТИ совместно с коллегами из России и Европы определили механизм транспорта протонов через клеточную мембрану светочувствительными белками. Полученные результаты найдут применение в развитии оптогенетики, в методике работы с нервными клетками.

Структурные перестройки в цитоплазматической части в ходе фотоцикла. Синие стрелки указывают на ключевые конформационные изменения. Широкая голубая стрелка указывает на предполагаемый путь перемещения протонов
Структурные перестройки в цитоплазматической части в ходе фотоцикла. Синие стрелки указывают на ключевые конформационные изменения. Широкая голубая стрелка указывает на предполагаемый путь перемещения протонов / ©Nature Structural & Molecular Biology / Автор: Ptolemocratia Acerronius

Результаты исследования ученых опубликованы в журнале Nature Structural & Molecular Biology. Транспорт протонов крайне важен для жизни клеток: как бактериальных, так и животных, поскольку он играет ключевую роль в энергообмене. Он осуществляется за счет светочувствительных белков родопсинов — они, подобно помпам, прокачивают через мембрану клетки различные ионы.

У микробов есть свой аналог родопсинов — бактериородопсины. Считается, что молекулярные механизмы перемещения протонов через различные типы протонопроводящих молекул имеют общие универсальные черты. Однако эти механизмы все еще мало изучены. В своей работе команда из Центра исследований молекулярных механизмов старения и возрастных заболеваний МФТИ использовала ксенородопсин из бактерии Bacillus coahuilensis, обнаруженной в Мексике.

«Мы в своей работе изучали ксенородопсины. Это подгруппа микробных родопсинов, которые прокачивают протон внутрь клетки против привычного направления. Их начали изучать недавно, с 2016 года. Наша команда впервые изучила их структуру прямо в процессе их работы при помощи времяразрешенной кристаллографии. Белок возбуждается лазером, а спустя сотни микросекунд облучается рентгеном. Таким образом — при помощи рентгеновской дифракции — нам удалось получить его структуру», — объяснил Федор Цыбров, научный сотрудник Центра исследований молекулярных механизмов старения и возрастных заболеваний МФТИ.

Авторы смогли определить аминокислоты ксенородопсина BcXeR, которые участвуют в процессе переноса протона. Оказалось, что процесс переноса осуществляется по «протонным проволокам» — цепочкам водородных связей, образованных между молекулами воды. Эти молекулы воды появляются только в процессе работы белка, поэтому ученые увидели их впервые.

По словам авторов, полученные результаты в будущем найдут применение в оптогенетике. Это методика исследования работы нервных клеток, основанная на внедрении в их мембрану специальных каналов — опсинов, реагирующих на возбуждение светом. Если на мозг воздействовать светом с определенной длиной волны, то те нейроны, которые имеют такие каналы, будут активироваться или наоборот: не смогут генерировать потенциалы действия.

«Ксенородопсины — это альтернатива текущему инструменту для возбуждения клеток светом. На основе полученных нами результатов можно создавать новые оптогенетические инструменты. Для этого необходимо найти такие микробные родопсины, которые бы хорошо работали в клетках млекопитающих и были бы безопасны при применении в организме. Нам, к сожалению, пока что удалось добиться функционирования нашего белка только в бактериях. С этой целью анализируются новые метагеномные данные, в которых обнаруживаются ранее не исследованные гены белков. Возможно, какой-то из них окажется пригодным для целей оптогенетики. В том числе при помощи текущего исследования станет понятно, как его можно будет модифицировать и улучшать», — дополнил Федор Цыбров.

В будущем исследователи также планируют точно установить биологическую роль ксенородопсинов в бактериальной клетке — пока что они не могут ответить на вопрос, зачем эти белки нужны бактериям. В исследовании, кроме научных сотрудников МФТИ, также приняли участие специалисты Геттингенского университета, Института биофизики общества Макса Планка( Германия), Института структурной биологии (Франция), Объединенного института ядерных исследований, МГУ имени Ломоносова и ряда других центров.

Нашли опечатку? Выделите фрагмент и нажмите Ctrl + Enter.
Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет), известен также как Физтех — ведущий российский вуз по подготовке специалистов в области теоретической, экспериментальной и прикладной физики, математики, информатики, химии, биологии и смежных дисциплин. Расположен в городе Долгопрудном Московской области, отдельные корпуса и факультеты находятся в Жуковском и в Москве.
Подписывайтесь на нас в Telegram, Яндекс.Новостях и VK
5 апреля, 15:48
Александр Березин

Четыре человека, летящие к Луне, столкнулись с целым рядом мелких неприятностей — от низкой температуры в начале работы до поломки мочевыводящей системы туалета на вторые сутки и необходимости взамен пользоваться пакетами. К счастью, пока самые крупные сложности удалось компенсировать. Но все они вместе могут сдвинуть ситуацию к решению, о котором Naked Science уже говорил в нашем видеоподкасте о миссии: не исключено, что при высадке астронавтов на Луне их корабль состыкуют со Starship не на окололунной, а уже на околоземной орбите.

6 апреля, 08:00
Evgenia Vavilova

Этот важный для исследователей инструмент разрушается за единичные фемтосекунды как будто без причины. В новом исследовании физики нашли два виновных в этом эффекта.

6 апреля, 11:13
Илья Гриднев

У северного побережья второго по величине острова Фиджи нашли участок суши площадью 3000 квадратных метров, на 70-90% состоящий из раковин съедобных моллюсков. Радиоуглеродная датировка показала, что отложениям около 1200 лет — скорее всего, остров сформировался из отходов древних поселенцев, веками перерабатывавших моллюсков на этом месте.

5 апреля, 15:48
Александр Березин

Четыре человека, летящие к Луне, столкнулись с целым рядом мелких неприятностей — от низкой температуры в начале работы до поломки мочевыводящей системы туалета на вторые сутки и необходимости взамен пользоваться пакетами. К счастью, пока самые крупные сложности удалось компенсировать. Но все они вместе могут сдвинуть ситуацию к решению, о котором Naked Science уже говорил в нашем видеоподкасте о миссии: не исключено, что при высадке астронавтов на Луне их корабль состыкуют со Starship не на окололунной, а уже на околоземной орбите.

3 апреля, 11:12
Максим Абдулаев

Японские экологи непрерывно измеряли напряжение внутри 37 диких грибов и зафиксировали между ними направленный обмен электрическими сигналами. Локальный полив земли рядом с одним плодовым телом вызвал мгновенный всплеск передачи информации по всей подземной сети. Этот коммуникационный процесс объединил в единую структуру даже генетически чужеродные организмы.

1 апреля, 16:17
Александр Березин

Единственной планетой Солнечной системы, подходящей для терраформирования, остается Марс. Однако способы разогреть его с помощью суперпарниковых газов требовали веков времени. Согласно расчетам из новой работы, микрочастицы особой формы могут сделать то же самое куда быстрее и дешевле.

19 марта, 10:58
Игорь Байдов

В парках некоторых стран все чаще можно заметить странную картину: синицы и воробьи вместо пуха и веточек приносят в клювах сигаретные окурки. Орнитологи из Польши решили выяснить, зачем птицы выстилают гнезда мусором, пропитанным никотином. Оказалось, пернатые нашли способ использовать вредную человеческую привычку для защиты своего потомства. Но, как это часто бывает в природе, у медали есть обратная сторона.

19 марта, 12:41
Игорь Байдов

Марсоход «Персеверанс» обнаружил в камнях на кромке кратера Езеро спектральные признаки минерала корунда, из которого на Земле образуются рубины и сапфиры. Такие спектры на Красной планете зарегистрировали впервые. Теперь ученые пытаются понять, при каких процессах он мог там сформироваться, ведь условия на Марсе заметно отличаются от тех, в которых корунд обычно образуется на Земле.

18 марта, 10:35
Илья Гриднев

За 10 лет лежания в почве сигаретные фильтры не растворились, а лишь замаскировались под грязь. Их пластиковые волокна распались на микрочастицы, намертво склеились с минералами и превратились во вторичный микропластик. Более того, на пятом году гниения мусор начал отравлять землю с новой силой.

[miniorange_social_login]

Комментарии

Написать комментарий
Подтвердить?
Подтвердить?
Причина отклонения
Подтвердить?
Не получилось опубликовать!

Вы попытались написать запрещенную фразу или вас забанили за частые нарушения.

Понятно
Жалоба отправлена

Мы обязательно проверим комментарий и
при необходимости примем меры.

Спасибо
Аккаунт заблокирован!

Из-за нарушений правил сайта на ваш аккаунт были наложены ограничения. Если это ошибка, напишите нам.

Понятно
Что-то пошло не так!

Наши фильтры обнаружили в ваших действиях признаки накрутки. Отдохните немного и вернитесь к нам позже.

Понятно
Лучшие материалы
Закрыть
Войти
Регистрируясь, вы соглашаетесь с правилами использования сайта и даете согласие на обработку персональных данных.
Ваша заявка получена

Мы скоро изучим заявку и свяжемся с Вами по указанной почте в случае положительного исхода. Спасибо за интерес к проекту.

Понятно