• Добавить в закладки
  • Facebook
  • Twitter
  • Telegram
  • VK
  • Печать
  • Email
  • Скопировать ссылку
01.08.2023
ИФХЭ РАН
543

Предложен новый способ предсказания антимикробной активности фотосенсибилизаторов

4.5

Ученые лаборатории биоэлектрохимии и лаборатории новых физико-химических проблем ИФХЭ РАН совместно с учеными ИОНХ РАН разработали новый метод предсказания структуры фотосенсибилизаторов для антимикробной фотодинамической терапии. Сочетая молекулярно-динамическое моделирование и биофизические эксперименты с липидными мембранами, ученые выявили структурные особенности молекул, обеспечивающие наилучшие антимикробные свойства в ряду родственных соединений. На основе полученных результатов было синтезировано соединение (порфирин фосфора(V)), антимикробная активность которого по отношению к такой важной внутрибольничной инфекции, как Acinetobacter baumannii, не уступает активности антибиотика «Колистин», а по отношению к кишечной палочке (Escherichia coli) почти в два раза превосходит активность антибиотика «Ампицилин».

Предложен новый способ предсказания антимикробной активности фотосенсибилизаторов
Предложен новый способ предсказания антимикробной активности фотосенсибилизаторов / ©Пресс-служба ИФХЭ РАН / Автор: Milonia Larcius

Результаты опубликованы в Frontiers in Molecular Biosciences. Фотосенсибилизаторы – это класс соединений, способных поглощать энергию квантов света и передавать ее другим молекулам, в первую очередь, кислороду, переводя его в возбужденное состояние, так называемый синглетный кислород, а также другие активные формы кислорода (АФК). АФК способны повреждать патологические клетки, что позволяет использовать фотосенсибилизаторы в качестве агентов для фотодинамической терапии. Обнаружение антимикробной активности фотосенсибилизирующих веществ привело к развитию нового направления в медицине — антимикробной фотодинамической терапии.

Сегодня использование антимикробной фотодинамической терапии, по большей части, ограничивается стоматологией и дерматологией. Хотя современные оптоволоконные устройства позволяют осветить почти любой орган, развитие фотодинамической антимикробной терапии затрудняется из-за слабой растворимости целевых веществ и их низкой стабильности. Самый большой их недостаток — неспособность воздействовать на одни только болезнетворные микробы, обходя полезные микроорганизмы. Поэтому поиск новых эффективных селективных фотосенсибилизаторов для борьбы с бактериями – это важная и актуальная задача. Среди наиболее изучаемых фотосенсибилизаторов в настоящее время используются соединения класса порфиринов, как природные, так и синтетические.

Исследования показывают, что разные молекулы фотосенсибилизаторов взаимодействуют с бактериями по-разному. Соответственно, синглетный кислород поражает разные структуры, например, мембрану клетки, или цитоплазму, или ДНК. При этом особо важно значение имеет расположение фотосенсибилизатора в клеточной мембране.

Взаимодействие молекулы фотосенсибилизатора с бактериальной клеткой зависит от химической структуры соединения, молекулярной массы, заряда, липофильных и гидрофильных свойств и так далее. Определение зависимости антимикробной активности от структуры фотосенсибилизирующей молекулы и стало главной задачей описанного исследования. Ранее сотрудниками ИФХЭ РАН было продемонстрировано, что фотодинамическая активность как порфиринов, так и их аналогов – фталоцианинов, непосредственно связана с их способностью внедряться в клеточную мембрану бактерии.

«В данной работе мы стремились выяснить, какие структурные особенности молекулы определяют ее эффективные антимикробные свойства при облучении светом. Мы провели биофизические исследования адсорбции, проницаемости и фотодинамической активности серии порфиринов фосфора на модельной липидной мембране. Соединения синтезированы в лаборатории новых физико-химических проблем ИФХЭ РАН в группе главного научного сотрудника нашего института и ИОНХ РАН, академика РАН Юлии Горбуновой.

Также мы проделали полноатомное молекулярно-динамическое моделирования взаимодействия молекулы с липидным матриксом бактериальной клетки, провели необходимые квантово-химические расчеты и эксперименты на двух культурах грамотрицательных бактерий. В результате выяснилось, что порфирины фосфора, проявлявшие антимикробную активность, располагались внутри клеточной мембраны параллельно ее поверхности. Порфирины с другим расположением лигандов антимикробную активность не проявляли.

Таким образом, наша работа открывает путь для направленного поиска новых фотосенсибилизаторов для антимикробной фотодинамической терапии» – рассказал заместитель директора ИФХЭ РАН по научной работе, заведующий лабораторией биоэлектрохимии, доктор физико-математических наук Олег Батищев.

Всемирная Организация Здравоохранения (ВОЗ) еще в 2014 году декларировала, что все больше и больше бактерий становятся нечувствительными к антибиотикам. От болезней, вызванных антибиотикорезистентными бактериями, ежегодно умирает около 700 тысяч человек. Предполагается, что это количество вырастет к 2050 году до 10 миллионов. Возможно, даже больше, из-за того, что во время пандемии, связанной с Covid-19, многократно и бесконтрольно увеличилось применение антибиотиков. При этом принципиально новые антибиотики на рынке появляются все меньше. В этой ситуации большое значение имеет создание новых, не использующих антибиотиков, методов борьбы с микробами.

«Ценность нашего результата — не только в том, что удалось синтезировать соединение, проявляющее высокую антимикробную активность по отношению к двум бактериям. Мы получили инструмент, благодаря которому можно предсказывать свойства новых потенциальных фотосенсибилизаторов. Метод заключается в сочетании биофизических экспериментов с компьютерным молекулярным моделированием, позволяющих направленно получать фотосенсибилизаторы с высокой антимикробной активностью» – отметила руководитель работ, академик РАН Юлия Германовна Горбунова. Работа выполнена при финансовой поддержке Российского Научного Фонда. 

Нашли опечатку? Выделите фрагмент и нажмите Ctrl + Enter.
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт физической химии и электрохимии им. А.Н. Фрумкина Российской академии наук — один из ведущих химических институтов Российской академии наук. Насчитывает более 800 сотрудников, среди которых 7 академиков, 9 членов-корреспондентов РАН, более чем 100 профессоров и 260 кандидатов наук. Проводимые в ИФХЭ РАН фундаментальные и прикладные исследования характеризуются многопрофильностью и включают следующие научные направления: поверхностные явления в коллоидно-дисперсных системах, адсорбция, физико-химическая механика; супрамолекулярные и наноразмерные системы для использования в современных высоких технологиях; химическое сопротивление материалов, защита металлов и других материалов от коррозии и окисления; химия и технология радиоактивных элементов, радиоэкология и радиационная химия; электрохимия. Успехи сегодняшних исследований опираются на уникальную экспериментальную базу Центра Коллективного Пользования, позволяющую решать практически любую задачу физико-химического исследования вещества или свойств его поверхности разнообразными современными методами. В их числе: электронная микроскопия и рентгеновский микроанализ, рентгеноструктурный анализ, рентгеновское малоугловое рассеяние, атомно-адсорбционный анализ, эллипсометрия, аннигиляция позитронов, хромато-масс-спектрометрия, инфракрасная, рамановская, фотоэлектронная, электронная спектроскопия, ядерный магнитный резонанс.
Подписывайтесь на нас в Telegram, Яндекс.Новостях и VK
Предстоящие мероприятия
Вчера, 19:20
Березин Александр

Западные колонии финикийцев включали сильнейшую морскую державу древнего Средиземноморья — Карфаген. Его жители использовали финикийский язык и поклонялись соответствующим богам. Теперь генетики заявили, что практически все эти люди — не потомки финикийских колонистов. Происхождение их в связи с этим довольно загадочно.

Вчера, 21:01
Юлия Трепалина

В прошлых исследованиях о скулшутинге в Соединенных Штатах некоторые эксперты называли основной причиной случаев массовой стрельбы в учебных заведениях наличие большого количества легальных «стволов» на руках у людей. Но в подобных работах редко систематически анализировали роль огнестрельного оружия в жизни школьных стрелков. По мнению профессора социологии Энн Нассауер из Эрфуртского университета (Германия), эта деталь роднит большинство совершавших такого рода нападения в США.

Вчера, 14:46
Юлия Трепалина

Многие, наверное, слышали фразу «Между ними возникла „химия“». Поясняя смысл выражения, часто говорят, что любовная химия между мужчиной и женщиной — это нечто сложное и с трудом поддающееся определению. Однако ученые не любят такой неясности, поскольку она мешает исследовать явление. Недавно группа психологов с помощью опроса выяснила основные компоненты взаимного влечения в паре, которое принято называть романтической, или любовной, химией.

20 апреля
Полина Меньшова

Распространено мнение, что, чем чаще пара занимается сексом, тем сильнее каждый из партнеров доволен отношениями. Международная команда исследователей проверила этот тезис.

18 апреля
Игорь Байдов

В 2006 году исследователи из Великобритании объявили, что легендарный антикитерский механизм, древнегреческий «компьютер», мог быть всего лишь игрушкой для демонстрации астрономических явлений. Авторы нового исследования подтвердили это, построив математическую модель на основе данных своих коллег, которая показала, что шестерни устройства заклинивало при запуске. Но несмотря на полученные результаты, ученые пытаются спасти репутацию древнего чуда техники, обвинив предыдущую команду в ряде ошибок.

18 апреля
Любовь

Примерно 41-42 тысячи лет назад на Земле произошел кратковременный сдвиг магнитных полюсов, который мог способствовать вымиранию неандертальцев, но не Homo sapiens — их выживание авторы нового исследования связали с появлением теплой одежды и добычей охры.

8 апреля
Березин Александр

До 13 тысяч лет назад в Северной Америке жил вид, который ученые до недавнего времени считали волком. Компания Colossal Biosciences объявила о возрождении этого вымершего вида, но биологические детали ставят ее заявление под серьезное сомнение.

2 апреля
Березин Александр

Известный американский отраслевой обозреватель Эрик Бергер взял интервью у экипажа космического корабля Boeing, из-за технических проблем которого два астронавта задержались на орбите на девять месяцев вместо одной недели. Детали, которые они озвучили, указывают на серьезные проблемы Starliner, о которых ранее умалчивали. Люди провели немало времени при глубоко нештатной температуре. При слегка другом сценарии миссии экипаж корабля мог погибнуть. Официальные заявления NASA и Boeing сразу после июньского полета к МКС, судя по интервью, были заведомо неправдивыми.

16 апреля
Андрей

Многие знают, как популярны сувениры из окаменелостей — зубы древних акул или полированные панцири аммонитов. Но чем реже встречаются такие артефакты, тем они ценнее, то есть на них можно много заработать. И это проблема для палеонтологов. Американский специалист по тираннозаврам оценил ущерб, который нанесла коммерческая добыча костей T. rex и подсчитал среднюю цену таких образцов. Оказалось, больше половины найденных тирексов находится в частных руках, а значит, для науки они недоступны или ненадежны.

[miniorange_social_login]

Комментарии

Написать комментарий
Подтвердить?
Подтвердить?
Причина отклонения
Подтвердить?
Не получилось опубликовать!

Вы попытались написать запрещенную фразу или вас забанили за частые нарушения.

Понятно
Жалоба отправлена

Мы обязательно проверим комментарий и
при необходимости примем меры.

Спасибо
Аккаунт заблокирован!

Из-за нарушений правил сайта на ваш аккаунт были наложены ограничения. Если это ошибка, напишите нам.

Понятно
Что-то пошло не так!

Наши фильтры обнаружили в ваших действиях признаки накрутки. Отдохните немного и вернитесь к нам позже.

Понятно
Лучшие материалы
Войти
Регистрируясь, вы соглашаетесь с правилами использования сайта и даете согласие на обработку персональных данных.
Ваша заявка получена

Мы скоро изучим заявку и свяжемся с Вами по указанной почте в случае положительного исхода. Спасибо за интерес к проекту.

Понятно
Ваше сообщение получено

Мы скоро прочитаем его и свяжемся с Вами по указанной почте. Спасибо за интерес к проекту.

Понятно