Основываясь на общенациональных данных из Дании, ученые оценили динамику передачи вариантов BA.1 и BA.2 — «классического» омикрон-штамма и его «стелс-версии».
В последнее время в Дании фиксируются рекордные показатели заболеваемости Covid-19 / © Henning Bagger, Ritzau Scanpix
Недавнее исследование ученых из Копенгагенского университета, Датского технического университета, Статистического управления Дании и научно-исследовательского Государственного института сывороток (Statens Serum Institut) показало, что подвид исходной линии омикрон-штамма BA.2, также известный как «стелс-омикрон» и впервые выявленный в Алжире, заразнее линии BA.1. Отчет опубликован на сайте препринтов medRXiv.org и пока не прошел рецензирование.
«Омикрон» (BA.1) за последние месяцы стал практически главной причиной подъема заболеваемости Covid-19 в мире: к 25 января на него пришлось 98,8% всех секвенированных случаев, данные о которых передали в общедоступную базу GISAID. Хотя во многих государствах пик очередной волны, по словам их властей, уже настал, с недавних пор ученые отслеживают версию этого варианта SARS-CoV-2 — BA.2. И в некоторых европейских и азиатских странах он начал вытеснять BA.1. Помимо BA.2, Всемирная организация здравоохранения упоминает BA.1.1.529 и BA.3 — они тесно связаны генетически, но каждый имеет собственные мутации.
Как отмечают ученые, выявлять BA.1 у пациентов оказалось чуть легче, чем предыдущие штаммы: он не дает одного из трех сигналов, по которым проводят ПЦР-тест (два — за пределами S-гена, третий — в S-гене (именно его у главного «омикрона» и нет)). Однако у BA.2 отсутствует эта особенность — он дает все три сигнала, — поэтому специалисты отслеживают его так же, как другие штаммы. К 28 января на BA.2 приходилось примерно 82% случаев в Дании, 9% в Великобритании и 8% в Соединенных Штатах Америки. Кстати, с 1 февраля Дания, невзирая на рост заболеваемости, первой в Евросоюзе сняла все ограничения, введенные из-за эпидемии, — все благодаря хорошим показателям вакцинации.
Итак, авторы новой работы основывались на данных, собранных с 20 декабря по 18 января. «Среди 8541 первичного случая в домохозяйствах, из которых 2122 пришлось на BA.2, мы выявили 5702 вторичные инфекции среди 17 945 потенциальных», — рассказывается в работе.
Как оказалось, при воздействии BA.2 вероятность заражения в течение семи дней составила 39% — против 29% у BA.1. В целом в обеих группах риск был выше у непривитых по сравнению с вакцинированными и ревакцинированными. Однако, сопоставив семьи, которые столкнулись с исходным «омикроном», с теми, кто заразился его субвариантом, во втором случае повышенная восприимчивость к инфекции сохранялась независимо от статуса вакцинации. Это, по мнению ученых, указывает на особую трансмиссивность BA.2 и способность уклоняться от иммунитета.
Непривитые с BA.2 чаще, чем зараженные BA.1, передавали инфекцию как вакцинированным, так и тем, кто сделал бустерные прививки. Хотя те, кто прошли первичную вакцинацию и впоследствии заразились «стелс-омикроном», реже, чем привитые с BA.1, распространяли инфекцию дальше. По предварительным данным, разницы в риске госпитализации между двумя линиями не выявили.
Upd. Подвид омикрон-штамма BA.2 выявили в России, заявила глава Роспотребнадзора Анна Попова. «Подавляющее большинство, которое относится к линии ВА.2, было выявлено в Москве, Республике Марий Эл, Ростовской области, Республике Башкортостан», — уточнила она.
Всего, по данным ВОЗ, случаи заражения этим субвариантом зафиксировали почти в 60 странах.
Комментарии
Что значит "не имеет один из целевых генов"?